Im Jahre 1920 zog Max Neuburger als Leiter des Instituts für Geschichte der Medizin in das seit dem Ende der Monarchie funktionslose Haus, und richtete in zwei Sälen das "Museum österreichischer Medizin" ein. Die Ausstellung wurde schließlich von Erna Lesky - ab 1960 Leiterin des Instituts für Geschichte der Medizin - in den Sechzigerjahren neu eingerichtet bzw. umgestaltet. Diese Räume bilden nun den zweiten Schwerpunkt der Schausammlung; hier ist die Entwicklung der Wiener Medizinischen Schulen detailliert dargestellt.