Leiter: Priv. Doz. Mag. Dr. Martin Bilban
eMail: martin.bilban@meduniwien.ac.at
Die Core Facility Genomics ist eine Serviceeinrichtung, mit dem Ziel genetische Ursachen weit verbreiteter Erkrankungen mittels Hochdurchsatz-Analysen zu charakterisieren. Basierend auf der Affymetrix GeneChip Technologie umfasst das Angebot der Microarray CF Geneexpressionsanalysen, Hochdurchsatzgenotypisierungen, Copy number-Variationsanalysen sowie weiteren genetischen Analysen.
Basierend auf globalen DNA und RNA-Analysen ermöglicht diese Technologie molekulare Wirkmechanismen und genetische Polymorphismen zu identifizieren, die zu einem besseren Verständnis von Krankheitsvorgängen beitragen. Die Microarray CF ist mit der aktuellsten Affymetrix Technologie ausgestattet; hierzu zählen zwei Hybridisierungsöfen, drei Fluidics-Stationen sowie ein 7G Scanner mit Autoloader. Jede GeneChip 450 Fluidics-Station verfügt über vier, mit state-of-the-art Leitfähigkeitsmesssytemen ausgestattete und individuell steuerbare Wasch- und Färbemodule. Der GeneChip 7G Scanner verfügt über eine sogenannte ‚flying objective‘ Linsentechnologie, die höhere Scangeschwindigkeiten, reduzierte optische Verzerrung und optimale Lichtemmissionseinstellungen garantiert. Darüberhinaus verfügt die Microarray CF über ein NanoDrop ND-8000 Spektrophotometer sowie einen Agilent 2100 Bioanalyzer, ein Kapillargelelektrophoresesystem basierend auf Fluoreszenzdetektion im Nanoformat. Der Agilent Bioanalyzer wird routinemässig zur Qualitätskontrolle von RNA und DNA eingesetzt. Das Nanodrop Spektralphotometer misst in einem Miminmalvolumen von 1µl Probe in einem Bereich von 220 bis 320 nm.
