Molekularbiologische Datenbanken

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Vorlesung

WS 2005/06

25.01.2006


WS 2005/06
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MOLEKULARBIOLOGISCHE DATENBANKEN

Mittwoch, 25. Jänner 2006

	DATENBANK	ZUGANG
	ÜBERSICHTSSEITEN
14:00	EBI NCBI / Verlinkung meddb	http://www.ebi.ac.uk/services/ http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Sitemap/index.html http://www.meddb.info/
	EDUCATIONAL RESOURCES
14.10	EBI NCBI	http://www.ebi.ac.uk/2can/ http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Education/index.html
	SEQUENZDATENBANKEN
14:20	GENBANK --> Info --> Beispiel EMBL . ENTREZ NUCLEOTIDE UNIGENE UNIPROT SWISSPROT	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Genbank/ . . http://srs.ebi.ac.uk/srs6bin/cgi-bin/wgetz?-page+LibInfo+-lib+EMBLRELEASE http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=Nucleotide http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=unigene http://www.expasy.uniprot.org/ http://us.expasy.org/sprot/
15.10	Pause
	GENOMISCHE DATENBANKEN
15:25	ENSEMBLE REFSEQ	http://www.ensembl.org/ http://www.ncbi.nlm.nih.gov/RefSeq/
	POLYMORPHISMUS DATENBANKEN
15.35	SNP --> IUPAC-Code	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=snp
	LITERATURDATENBANKEN
15.50	MEDLINE OMIM PUBMEDCENTRAL BOOKS	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi http://www.ebi.ac.uk/Databases/MEDLINE/medline.html http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=OMIM http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=pmc http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=Books
16:10	Pause
	STRUKTURDATENBANKEN
16:20	PDB -- raswin	http://www.rcsb.org/pdb/
	KLEINE, ABGELEITETE DATENBANKEN
16.35	PROSITE PRINTS BLOCKS	http://www.expasy.org/prosite/ http://umber.sbs.man.ac.uk/dbbrowser/PRINTS/ http://blocks.fhcrc.org/
	MUTATIONSDATENBANKEN
16.45	IDBASES HGVBASE	http://bioinf.uta.fi/base_root/ http://hgvbase.cgb.ki.se/
	PATHWAY - DATENBANKEN
17.00	BIOCARTA	http://www.biocarta.com/
17.10	Pause
	ONKOLOGISCHE DATENBANKEN
17:20	ATLAS OF GENETICS CANCER CHROMOSOMES . ONCOMINE	http://www.infobiogen.fr/services/chromcancer/index.html http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?CMD=Home&DB=cancerchromosomes http://www.oncomine.org
	TOOLS
17.45	BLAST . FASTA	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/ http://www.ebi.ac.uk/blast/ http://www.ebi.ac.uk/fasta33/
	METASUCHE
	NCBI	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gquery/gquery.fcgi
	LITERATUR
	Nucleic Acids Research	http://nar.oxfordjournals.org/content/vol34/suppl_1/index.dtl

GenBank

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