Im Kernbereich Forschung der medizinischen Universität werden vier Bereiche definiert, die das künftige Forschungsprofil der Universität bestimmen werden. Darunter wird die "Allergologie, Immunologie & Infektiologie" an erster Stelle gereiht.
Das IPA trägt aktiv zu dieser Schwerpunktbildung bei, besonders durch den FWF-Sonderforschungsbereich SFB F46, mit dem Titel „Molecular and immunological strategies for prevention, diagnosis and treatment of Type I allergies“(Sprecher: Rudolf Valenta). Heute wirken mehrere Arbeitsgruppen des IPA in diesem SFB mit (Barbara Bohle, Heimo Breiteneder, Susanne Vrtala, Erika Jensen-Jarolim).
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